Génomique comparative et évolutive des fonctions liées à la reproduction

Génomique comparative et évolutive des fonctions liées à la reproduction

Génomique comparative et évolutive des fonctions liées à la reproduction

Génomique comparative et évolutive des fonctions liées à la reproduction

Les génomes des vertébrés "supérieurs" contiennent en moyenne 23000 à 25000 gènes, et on ne connaît la fonction biologique que pour environ 10 % d'entre eux. Une alternative aux stratégies lourdes de création de mutants in vivo est de s'appuyer sur des données de physiologie et de génomique comparative, et plus précisément sur l'étude systématique de l'évolution des gènes, potentiellement explicative de l'évolution des grandes fonctions entre espèces, et sur les comparaisons de grands fragments de génomes voire de génomes entiers. L’équipe s’intéresse entre autres à l’évolution de gènes liés à la reproduction et à la gamétogenèse ainsi que ceux liés au métabolisme énergétique. L’équipe étudie en particulier les moments de naissance, de mort, de divergence et de convergence de gènes liés à la reproduction, par une approche phylogénétique.

Estienne A, Jarrier P, Staub C, Venturi E, Le Vern Y, DiClemente N, Monniaux D, Monget P. AMH expression in the ovary: a comparative study in bovine and porcine granulosa cells. 2020. Biol Reprod, 103(3) 572-582. https://doi.org/10.1093/biolre/ioaa077

Grandchamp A. & Monget P. The membrane receptors that appeared before their ligand: The different proposed scenarios. 2020. PLoS One 15(5): e0231813. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0231813

Grandchamp A, Tahir S, Monget P. Natriuretic peptides appeared after their receptors in vertebrates. BMC Evol Biol. 2019 Nov 26;19(1):215. doi: 10.1186/s12862-019-1517-x.

Grandchamp A, Piégu B, Monget P. Genes Encoding Teleost Fish Ligands and Associated Receptors Remained in Duplicate More Frequently than the Rest of the Genome. Genome Biol Evol. 2019 May 1;11(5):1451-1462. doi: 10.1093/gbe/evz078.

Grandchamp A, Monget P. Synchronous birth is a dominant pattern in receptor-ligand evolution. BMC Genomics. 2018 Aug 14;19(1):611. doi: 10.1186/s12864-018-4977-2.

Moros-Nicolás C, Fouchécourt S, Goudet G, Monget P. Genes Encoding Mammalian Oviductal Proteins Involved in Fertilization are Subjected to Gene Death and Positive Selection. 2018. J Mol Evol. 86:655-667. https://doi.org/10.1007/s00239-018-9878-0

Elis S, Desmarchais A, Cardona E, Fouchecourt S, Dalbies-Tran R, Nguyen T, Thermes V, Maillard V, Papillier P, Uzbekova S, Bobe J, Couderc JL, Monget P. Genes Involved in Drosophila melanogaster Ovarian Function Are Highly Conserved Throughout Evolution. Genome Biol Evol. 2018 Oct 1;10(10):2629-2642. doi: 10.1093/gbe/evy158.

Contact : philippe.monget[@]inrae.fr

Inra Val de Loire Image : P. Monget

Arbre phylogénétique des vertébrés montrant la perte d'un gène codant une protéine de la zone pellucide chez les mammifères.
Réalisé par Philippe Monget

(Article de  référence : Goudet G., Mugnier S., Callebaut I., Monget P., 2008. Phylogenetic analysis and identification of pseudogenes reveal a progressive loss of zona pellucida genes during evolution of vertebrates. Biol Reprod 78: 796-806)

Date de modification : 02 août 2023 | Date de création : 13 juin 2018 | Rédaction : Equipe BINGO